Ammonium (NH₄⁺) kann ähnlich wie Kalium (K⁺) zwischen den Schichtpaketen der Tonminerale fest gebunden werden. Auf tonreichen Böden können große Mengen fixiert werden, insbesondere durch aufgeweitete Illite und Vermikulite. Diese N-Fraktion ist nur schwer für die Pflanzen verfügbar. Die Fraktion des fixierten Ammoniums dient so als Stickstoffspeicher, der Ammonium weitgehend vor Nitrifikation und Einwaschung schützt.